Абърдийн е основан през 1881 година. Шотландският тим е евентуалният съперник на Левски в третия квалификационен кръг на Лига Европа, ако „сините“ отстранят Марибор.

От 1905 година Абърдийн неизменно е член на елитната дивизия на страната си. Печели Купата през 1947 година, а първата си шампионска титла вдига през 1955-а.  Отборът е става шампион и през 1980 година.

Легендарният сър Алекс Фъргюсън е бил наставник на Абърдийн в периода от 1978 до 1986 година.

Дебютът на сър Алекс в евротурнирите е срещу българския Марек.